Kolese Kanisius merupakan salah satu dari kolese-kolese lain di seluruh dunia yang dikelola oleh  para Imam dari ordo Serikat Yesus (SJ) atau juga sering dikenal dengan Jesuit; dan merupakan salah satu dari 8 kolese Jesuit di Indonesia. Berbeda dengan 7 kolese lainnya yang adalah Sekolah Menengah Atas, Kolese kanisius terdiri atas dua unit sekolah yaitu Sekolah Menengah Pertama (SMP) dan Sekolah Menengah Atas (SMA), Adapun kolese-kolese Jesuit lainnya di Indonesia yaitu:

  1. Kolese St. Mikael (STM dan ATMI putra) di Solo
  2. Kolese De Britto (SMA putra) di Yogyakarta
  3. Seminari Menengah Petrus Kanisius (SMA putra) di Mertoyudan, Magelang
  4. Kolese Loyola (SMA putra-putri) di Semarang
  5. Sekolah Menengah Teknologi Industri Kayu -PIKA (putra-putri) di Semarang
  6. Kolese Gonzaga (SMA putra-putri) di Jakarta
  7. Kolese Le Coq d’Armanville (SMA putra-putri) di Nabire, Irian Jaya